Cet article questionne le rôle de la production des savoirs sur l’état écologique des milieux dans la gestion et la mise en œuvre de politiques de surveillance et de protection des ressources en eau utilisées pour la production d’eau potable en Afrique subsaharienne. Sur la base d’une recherche interdisciplinaire réalisée en Côte d’Ivoire et au Sénégal par une équipe comprenant des sociologues et des écologues, l’article montre comment des savoirs experts d’évaluation de la qualité des milieux interagissent avec les jeux d’acteurs, les structures de gestion existantes et les représentations locales de ces mêmes milieux.