L’originalité du CBSS réside dans le fait qu’il valorise les semences paysannes qui en fait ne sont pas prises en compte dans le système conventionnel alors qu’elles représentent plus de 90% des semences utilisées dans la sous-région. A cet effet, le CBSS a créé les nouveaux concepts de « semence de qualité acceptable » et de « semence contrôlée » pour d’une part, aider à améliorer la qualité des semences paysannes et d’autre part, leur donner un contenu scientifique, technique et économique ains qu’un cadre d’évolution réglementaire.